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文献查全方法之PubMed篇

  • 轩鸿青
  • 2019-05-18 08:44:02
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记得研究生刚刚入学时导师就让我慢慢读阅文献,学习科研方法,于是我傻乎乎的打开电脑,面对浩如烟海的文献数据库,无从下手,不知道该如何...

记得研究生刚刚入学时导师就让我慢慢读阅文献,学习科研方法,于是我傻乎乎的打开电脑,面对浩如烟海的文献数据库,无从下手,不知道该如何做能检索到自己想要的文献。明明知道宝藏藏在哪里,却找不到寻宝的路,无比迷茫。后来我自己也琢磨出来了一些技巧,可是还不太理想,达不到满意的效果,还是不知道如何构建合理的表达式才能让既全面又精确的查找到自己所要的文献,不能正确的应用“且”、“或”、“非”的巧妙组合去控制检索范围。直到无意间听了大神的几节课之后,我才茅塞顿开,恍然大悟,原来这样才是检索文献的最佳姿势。

下面以“放射外科手术治疗对于治疗早期非小细胞肺癌的临床疗效”为案例进行PubMed检索。如何查全既患有早期非小细胞肺癌又同时接受放射外科手术治疗的相关研究呢?我们分三步进行。

第一步:检索出有关“非小细胞肺癌的相关全部文献”

 I. 先查找非小细胞肺癌的主题词

   打开中国生物医学文献数据库,点击主题检索,输入要检索的词,” 非小细胞肺癌,点击查找就可以看到非小细胞肺癌的主题词为“, 非小细胞肺”【图1】,再点击该主题词就可以查到非小细胞肺的英文主题词为“Carcinoma, Non-Small-Cell Lung”,即为PubMed上的MeSH【图2】。到此为止我们就查找到了非小细胞肺癌在PubMed上的主题词。注:* 美国国立医学图书馆《医学主题词表(MeSH)》中译本、《中国中医药学主题词表》是中国生物医学文献数据库(CBM)进行主题标引和主题检索的依据。基于主题概念检索文献,利于提高查全率和查准率。

文献查全方法之PubMed篇

图1

文献查全方法之PubMed篇

图2

II. 利用主题词在pubmed上检索文献

进入PubMed 在输入框的左侧选择MeSH,在输入框中输入刚刚在中国生物医学文献数据库中查找到的非小细胞肺癌的主题词“Carcinoma, Non-Small-Cell Lung”,点击Searsh按钮【图3】,进入主题词界面【图4】。在该界面我们除了可以看到主题词外还可以看到Entry Terms下的自由词,我们应首先把Entry Terms下的自由词复制并保存起来以便一会儿检索自由词时使用,然后我们点击右上侧的Add to search builder加入检索框,继续点击其下侧的Search PubMed。到此,以“Carcinoma, Non-Small-Cell Lung”为主题词的检索已经完成【图5】。

文献查全方法之PubMed篇

图3

文献查全方法之PubMed篇

图4

文献查全方法之PubMed篇

图5

文献查全方法之PubMed篇

图6

文献查全方法之PubMed篇

图7

 III. 在PbuMed中检索小细胞肺癌的自由词

点击【图5】搜索框下Advanced按钮进入高级检索模式【图6】,接下来把刚刚复制的Entry Terms下的自由词一条一条的添加到检索框中。注意,自由词之间用OR链接,一般用Title/Abstract来限制自由词。待所有自由词都添加、限定及链接完毕后点击下方的Search,自此自由词检索完毕,再次点击搜索框下Advanced按钮进入高级检索模式。这时,我们可以看到检索历史里记录的我们刚刚检索的自由词和主题词的记录【图7】。分别点击Add按钮,把主题词自由词的检索结果放入上方的检索框并用OR 链接,点击Searsh。到此为止,我们对非小细胞肺癌的相关研究算是检索完毕。注意,主题词与自由词之间仍以OR链接。一句话请记住,组间AND,组内OR,组内词目要全到


第二步:检索出有关“放射外科手术治疗对于治疗早期非小细胞肺癌的临床疗效”

  该步重复第一步。在此省略

第三步:合并前两项检索结果

  经过第一步及第二步,我们成功检索到关于非小细胞肺癌及放射外科手术的所有研究,在此步我们对以上检索结果进行综合。特别注意的是因为是组间,我们需采用AND的链接方式进行。可以看到,经过第三步,我们的检索结果相对于前两步有所减少。这是因为,通过AND后,系统查找的研究文献里既要包含非小细胞肺癌的相关研究,又包含放射外科手术的相关研究。

通过以上三步,我们基本检索到了接受放射外科手术的非小细胞肺癌的全部研究。达到了我们的检索目的。

希望小伙伴们喜欢,不足之处多多指教。谢谢。

附件

1.PubMed 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

2.中国生物医学文献数据库 网址:http://www.sinomed.ac.cn/zh/

3.本文中我自己的检索步骤 

history.csv

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